哈尔滨专业对样本进行宏病毒组测序

时间:2020年06月01日 来源:

上海探普生物科技有限公司对样本进行宏病毒组测序以后的数据分析是如何进行的?

寄生性质的生物下机数据一般都伴随大量的宿主和其他微生物的数据。探普生物基于该特点,优化了自有数据库,搭载了**的生物信息学分析流程,可处理复杂背景下的目标物种序列。生物信息学流程主要包括,1,基于数据库,去除宿主数据和其他微生物数据,筛选出目的序列,然后进行序列组装,物种分类,丰度统计。样本数量达到一定标准还可以进行差异分析。现有数据库不够完善,出于对数据真实性的尊重,探普生物一般不进行功能相关的分析。预测性质的分析可以根据具体项目评估数据库质量后进行。


哈尔滨专业对样本进行宏病毒组测序

在探普生物进行病毒宏基因组测序流程是怎么样的?

在探普生物进行病毒宏基因组测序的流程非常简单,简而言之,客户只需要说清楚样品情况,准备样品即可,其他事宜都由探普来进行安排。大致流程如下:

1)与销售人员沟通项目需求和样本情况;

2)探普生物工作人员拟定项目合同,双方协商合同内容后签字盖章;

3)按样本准备指南准备好样本,填写信息单后通知销售人员预订干冰,安排样本寄运输;

4)客户支付项目启动款,探普生物启动项目实验和分析并提供测序报告;

5)客户支付项目尾款,探普生物提交测序数据和分析结果;

6)售后问题处理,项目结题。


湖北口碑好对样本进行宏病毒组测序服务介绍

会对样本进行宏病毒组测序有什么意义?

 和细菌的宏基因组相似,病毒宏基因组也是旨在研究微生物群体中的物种分布规律和差异,通过大数据分析微生物群体的功能。通过对样本进行宏病毒组测序,我们可以了解单个样本里有什么病毒,相对含量是多少,优势物种是什么;还可以了解不同群体间物种分布有何差异,结合样本来源和其所属环境,指导下游的实验方向。于科研,好的群体和样本可以发表质量的学术论文;于临床,可以辅助临床医生进行微生物侵染类疾病诊断并在一定程度提供用药指导。随着数据库日趋完善,对样本进行宏病毒组测序以后,我们将获得越来越丰富的信息,它有朝一日会成为研究者非常常规的研究手段。上海探普生物科技有限公司立志专门解决病毒方向的基因组研究难题,开发了整套的样本处理和生信分析流程,基于这套流程,研究者们想对样本进行宏病毒组测序就很容易实现了。


上海探普生物科技有限公司对样本进行宏病毒组测序有什么优势?

全国开设病毒宏基因组测序的公司不超过3家,只有探普生物是专门为病毒研究者服务的,探普生物的研发团队和实验团队都来自全国各地病毒学、微生物学专业的高校,硕士及以上学历成员超过60%,团队具备普通测序实验和分析基础之外,同时具备病毒学及微生物学的学术背景,相当了解病毒相关样本情况、研究方向等。研究者在项目咨询的时候就可以明显感觉到探普生物的专业性,沟通顺畅,省时省力。由于探普生物具备处理大量多样的病毒样本的经验,熟知各类病毒样本的特性,因此对于样本准备有独特的方法指南,这就为后续的分析结果打下了牢固的基础,减少了客户和公司之间的摩擦,也几乎没有售后问题。独有的实验和分析流程可兼容高复杂度低浓度的病毒核酸。因此探普生物的病毒测序结果质量有保障外还具备:样本准备简单,商务流程通畅,回复消息及时,反馈处理迅速等优点。


哪些应用场景会对样本进行宏病毒组测序?

宏病毒组其实就是病毒的宏基因组(meta-genomics),该技术是随着高通量测序技术的兴起而发展起来的。该技术主要是使用大量微生物群体样本的测序数据和生物信息学分析手段,以多种数据库为基础,进行群体的种类和功能分析。因此,它主要的应用场景在于微生物群体研究,如肠道微生物、皮肤微生物、口腔微生物、水体微生物、土壤微生物等。一直以来宏基因组技术都是在细菌领域使用,病毒的样本收集困难、文库构建繁琐、数据库不完善,因此宏基因组技术未能获得广泛应用。上海探普生物科技有限公司立志专门解决病毒方向的基因组研究难题,开发了整套的样本处理和生信分析流程,基于这套流程,研究者们想对样本进行宏病毒组测序就很容易实现了。


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